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경기도 용인시 원삼중을 나와 인천 [[대건고]]를 졸업한 후, [[인천 유나이티드]]에 [[우선지명]] 되었다. 이후 프로로 입단시키지 않고 [[아주대학교]]로 진학시켰는데, 입단 후 [[춘계 1,2학년 전국대학축구대회]]에서 아주대를 우승으로 이끌면서 될성부를 떡잎이란 평을 얻었다.<ref>문선수는 동대회에서 최우수 선수에 뽑혔다.</ref> 이후 1학년임에도 불구하고 아주대의 3톱중 한 자리를 꿰찬 문선수는 각급 대회에서 두각을 나타냈고, 이런 활약에 힘입어 U-20 대표팀으로 차출되어 FIFA U-20 월드컵에서 스페인을 상대로 16강전에 선발 출장하여 한치도 밀리지 않는 승부를 보여주기도 하였다. 이후 [[홍명보]] 감독이 이끄는 올림픽 대표로도 선발이 되기도 하였고, 아주대에서도 [[전국대학축구대회]]에서 우승을 차지하는데 큰 공헌을 하였다.<ref>이 대회 우승은 아주대에 있어서는 11년만의 전국무대 재패였다.</ref>

경기도 용인시 원삼중을 나와 인천 [[대건고]]를 졸업한 후, [[인천 유나이티드]]에 [[우선지명]] 되었다. 이후 프로로 입단시키지 않고 [[아주대학교]]로 진학시켰는데, 입단 후 [[춘계 1,2학년 전국대학축구대회]]에서 아주대를 우승으로 이끌면서 될성부를 떡잎이란 평을 얻었다.<ref>문선수는 동대회에서 최우수 선수에 뽑혔다.</ref> 이후 1학년임에도 불구하고 아주대의 3톱중 한 자리를 꿰찬 문선수는 각급 대회에서 두각을 나타냈고, 이런 활약에 힘입어 U-20 대표팀으로 차출되어 FIFA U-20 월드컵에서 스페인을 상대로 16강전에 선발 출장하여 한치도 밀리지 않는 승부를 보여주기도 하였다. 이후 [[홍명보]] 감독이 이끄는 올림픽 대표로도 선발이 되기도 하였고, 아주대에서도 [[전국대학축구대회]]에서 우승을 차지하는데 큰 공헌을 하였다.<ref>이 대회 우승은 아주대에 있어서는 11년만의 전국무대 재패였다.</ref>

이런 활약에 당초 인천은 문상윤을 아주대 졸업 -> 군 복무 이후 인천으로 다시 불러들이려 했으나, 이미 탈 대학교 레벨이 된 문상윤에게 더이상의 대학 생활은 시간 낭비라 판단, 2012년 인천에 입단시켰다. 어린이날 전북과의 홈경기에서 멋진 프리킥으로 데뷔골을 신고했으며, 이후 선발과 교체를 오가면서 출전중이다.

이런 활약에 당초 인천은 문상윤을 아주대 졸업 -> 군 복무 이후 인천으로 다시 불러들이려 했으나, 이미 탈 대학교 레벨이 된 문상윤에게 더이상의 대학 생활은 시간 낭비라 판단, 2012년 인천에 입단시켰다.

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